3 Temmuz 1992 tarihinde, 3837 sayılı kanunla kurulan Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi’nin tarihçesi şöyledir:
1992’de Çanakkale Eğitim Fakültesi, Trakya Üniversitesi'nden devredildi.
1992’de Biga İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi kuruldu.
1992’de Fen Edebiyat Fakültesi kuruldu.
1992’de İlahiyat Fakültesi kuruldu.
1992’de Mühendislik Fakültesi kuruldu.
1992’de Ziraat Fakültesi kuruldu.
1992’de Biga Meslek Yüksekokulu kuruldu.
1992’de Çanakkale Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu kuruldu.
1992’de kurulan Su Ürünleri Fakültesi, 2012’de Deniz Bilimleri ve Teknolojisi adını aldı.
1992’de kurulan Turizm İşletmeciliği ve Otelcilik Yüksekokulu, 2013’te Turizm Fakültesi adını aldı.
1992’de kurulan Çanakkale Meslek Yüksekokulu, 2011’de ikiye ayrılarak Çanakkale Sosyal Bilimler Meslek Yüksekokulu ve Çanakkale Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu isimlerini aldı.